Không còn xa lạ với bộ truyện tranh Doraemon cùng những nhân vật Chaien, Xeko, Nobita,... người chơi sẽ nhanh chóng hòa mình vào thế giới hoạt hình để "Giải cứu Xuka" dưới lòng đáy biển.

Câu chuyện được bắt đầu với tin một con tàu lạ chìm ngoài khơi vùng biển. Vào kì nghỉ hè, nhóm bạn Doremon đã có cuộc thám hiểm xuống đáy biển. Trong lúc ấy, con tàu ở ngoài khơi đột nhiên biến mất. Cả nhóm đi thám hiểm và phát hiện con tàu nọ bị trôi dạt đến đây. Cùng lúc đó họ bắt gặp chiếc tàu lạ và con bạch tuộc đầu voi. Để tìm tung tích của bọn quỷ biển, Xuka đã tự nguyện làm con mồi bám theo đến tận căn cứ của chúng....